Une étude montre comment les variations de l’expression du gène de l’hôte du SRAS-CoV-2 peuvent être liées aux variations de la sensibilité au COVID-19 et de la gravité des symptômes – Science

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Les gens ont des susceptibilités différentes au SRAS-CoV-2, le virus à l’origine de la pandémie de COVID-19, et développent divers degrés de fièvre, de fatigue et de problèmes respiratoires – des symptômes courants de la maladie. Qu’est-ce qui pourrait expliquer cette variation?

Les scientifiques de l’Université de Californie, de Riverside et de l’Université de Californie du Sud peuvent avoir une réponse à ce mystère.

Dans un article publié dans L’informatique en médecine débloquée, les chercheurs montrent pour la première fois que la variabilité observée du COVID-19 peut avoir des sources moléculaires sous-jacentes. Cette découverte pourrait aider au développement de stratégies prophylactiques et thérapeutiques efficaces contre la maladie.

«Sur la base des biomarqueurs et des profils moléculaires des individus, on espère développer de meilleurs tests médicaux pour s’adapter à ces variations dans la surveillance de la transmission du virus et de la pathologie de la maladie, ce qui aide à orienter les options d’atténuation et de traitement», a déclaré Sika Zheng, professeur agrégé de sciences biomédicales à l’École de médecine de l’UC Riverside, qui a dirigé l’étude.

Le virus SARS-CoV-2 détourne des molécules hôtes humaines pour la fusion et la réplication du virus, attaquant les fonctions cellulaires humaines. Ces molécules hôtes humaines sont collectivement appelées gènes hôtes du SRAS-CoV-2. Les chercheurs ont systématiquement analysé l’expression du gène de l’hôte du SRAS-CoV-2, leurs variations et la dépendance à l’âge et au sexe dans la population humaine à l’aide de la génomique, de la transcriptomique et de la protéomique à grande échelle.

Ils ont d’abord découvert que la similitude de l’expression du gène hôte est généralement corrélée à la vulnérabilité des tissus à l’infection par le SRAS-CoV-2. Parmi les six gènes les plus exprimés de manière variable dans la population, ils ont identifié ACE2, CLEC4G et CLEC4M, qui sont connus pour interagir avec la protéine de pointe du SRAS-CoV-2. Une expression plus élevée de ces gènes augmente probablement la possibilité d’être infecté et de développer des symptômes graves. D’autres gènes variables comprennent SLC27A2 et PKP2, tous deux connus pour inhiber la réplication du virus; et PTGS2, qui intervient dans la réponse à la fièvre. Les auteurs ont également identifié des variantes génétiques liées à l’expression variable de ces gènes.

Selon le Zheng, les profils d’expression de ces gènes marqueurs peuvent aider à mieux catégoriser les groupes à risque.

«Une évaluation des risques plus complète peut mieux guider le stade précoce de la distribution des vaccins», a-t-il déclaré. «Des tests peuvent également être développés pour inclure ces marqueurs moléculaires afin de mieux suivre la progression de la maladie. Ils peuvent également être utilisés pour stratifier les patients afin d’évaluer et, finalement, améliorer l’efficacité du traitement.

En plus d’identifier les gènes hôtes du SRAS-CoV-2 les plus variables, les résultats de l’étude suggèrent que des facteurs génétiques et biologiques sous-tendent la variation de la population dans l’infection par le SRAS-CoV-2 et la gravité des symptômes.

“Bien sûr, ceux-ci devront être confirmés avec plus de données. Mais les résultats indiquent une valeur potentielle d’un projet eQTL à grande échelle pour profiler les génotypes et le transcriptome des patients COVID-19”, a déclaré Zheng.

Ensuite, les chercheurs prévoient d’analyser davantage les génotypes à grande échelle et les données de transcriptome des patients COVID-19 lorsqu’ils seront disponibles et d’affiner les résultats pour une association et une précision accrues.

Zheng a été rejoint dans la recherche par Liang Chen de l’USC. Des subventions des National Institutes of Health ont soutenu l’étude.

Source de l’histoire:

Matériaux fourni par Université de Californie – Riverside. Original écrit par Iqbal Pittalwala. Remarque: le contenu peut être modifié pour le style et la longueur.

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